Hinamatsuri bercerita tentang Nitta, seorang anggota yakuza yang kehidupannya tiba-tiba berubah dengan kemunculan seorang gadis misterius bernama Hina yang memiliki kekuatan supranatural. Hina yang awalnya dingin dan tanpa emosi mulai belajar dan berinteraksi dengan lingkungan barunya, menciptakan situasi yang penuh humor dan kehangatan. Seiring waktu, Nitta dan Hina ditemani oleh karakter lain yang juga memiliki kekuatan aneh seperti Anzu, menciptakan hubungan yang unik dan menghibur. Melalui berbagai tantangan, komik ini mengeksplorasi tema keluarga, persahabatan, dan bagaimana kehidupan bisa berubah secara tak terduga oleh kehadiran seseorang yang spesial.